MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A plasmid pSERP

Total Repeats: 510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006663	GAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
2	NC_006663	TAA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
3	NC_006663	ATA	2	6	175	180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
4	NC_006663	TTCA	2	8	182	189	25 %	50 %	0 %	25 %	57854753
5	NC_006663	ATG	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854753
6	NC_006663	A	6	6	211	216	100 %	0 %	0 %	0 %	57854753
7	NC_006663	ATA	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
8	NC_006663	A	8	8	300	307	100 %	0 %	0 %	0 %	57854753
9	NC_006663	ATG	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854753
10	NC_006663	AAT	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
11	NC_006663	ACT	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854753
12	NC_006663	TAAA	2	8	364	371	75 %	25 %	0 %	0 %	57854753
13	NC_006663	CAA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854753
14	NC_006663	TAA	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
15	NC_006663	AGA	3	9	515	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
16	NC_006663	ATT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854753
17	NC_006663	CGA	2	6	553	558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854753
18	NC_006663	ATA	2	6	559	564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
19	NC_006663	AAG	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
20	NC_006663	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
21	NC_006663	ATCA	2	8	615	622	50 %	25 %	0 %	25 %	57854753
22	NC_006663	ACA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854753
23	NC_006663	CAAC	2	8	639	646	50 %	0 %	0 %	50 %	57854753
24	NC_006663	AAGAGA	2	12	673	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
25	NC_006663	TAA	2	6	709	714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
26	NC_006663	AAG	2	6	715	720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
27	NC_006663	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
28	NC_006663	ATA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
29	NC_006663	AGG	2	6	763	768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57854753
30	NC_006663	ACC	2	6	773	778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854753
31	NC_006663	A	6	6	780	785	100 %	0 %	0 %	0 %	57854753
32	NC_006663	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854753
33	NC_006663	TAA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854754
34	NC_006663	TA	3	6	1032	1037	50 %	50 %	0 %	0 %	57854754
35	NC_006663	TCTT	2	8	1101	1108	0 %	75 %	0 %	25 %	57854754
36	NC_006663	GTTTAA	2	12	1176	1187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57854754
37	NC_006663	ATT	2	6	1196	1201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854754
38	NC_006663	TGC	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57854754
39	NC_006663	ATGT	2	8	1335	1342	25 %	50 %	25 %	0 %	57854754
40	NC_006663	TCA	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854754
41	NC_006663	TAA	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854754
42	NC_006663	T	6	6	1429	1434	0 %	100 %	0 %	0 %	57854754
43	NC_006663	TTC	2	6	1442	1447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854754
44	NC_006663	ATG	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854754
45	NC_006663	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	57854754
46	NC_006663	TAG	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854754
47	NC_006663	CAT	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854755
48	NC_006663	TTAA	2	8	1907	1914	50 %	50 %	0 %	0 %	57854755
49	NC_006663	TAT	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854755
50	NC_006663	T	6	6	1957	1962	0 %	100 %	0 %	0 %	57854755
51	NC_006663	TTTA	2	8	1996	2003	25 %	75 %	0 %	0 %	57854755
52	NC_006663	AGC	2	6	2017	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854755
53	NC_006663	T	6	6	2038	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	57854755
54	NC_006663	TAATT	2	10	2060	2069	40 %	60 %	0 %	0 %	57854755
55	NC_006663	GTT	2	6	2121	2126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57854755
56	NC_006663	T	6	6	2131	2136	0 %	100 %	0 %	0 %	57854755
57	NC_006663	CCA	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854755
58	NC_006663	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854755
59	NC_006663	ATC	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854755
60	NC_006663	T	7	7	2289	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	57854755
61	NC_006663	TTA	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854755
62	NC_006663	T	8	8	2446	2453	0 %	100 %	0 %	0 %	57854755
63	NC_006663	GCAATT	2	12	2513	2524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57854755
64	NC_006663	TAA	2	6	2664	2669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
65	NC_006663	GTA	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854756
66	NC_006663	T	6	6	2711	2716	0 %	100 %	0 %	0 %	57854756
67	NC_006663	TA	3	6	2720	2725	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
68	NC_006663	TGCT	2	8	2778	2785	0 %	50 %	25 %	25 %	57854756
69	NC_006663	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
70	NC_006663	AAT	2	6	2840	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
71	NC_006663	CATAA	2	10	2885	2894	60 %	20 %	0 %	20 %	57854756
72	NC_006663	ACC	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854756
73	NC_006663	ATA	2	6	2958	2963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
74	NC_006663	TTA	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
75	NC_006663	TTA	2	6	3023	3028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
76	NC_006663	A	7	7	3075	3081	100 %	0 %	0 %	0 %	57854756
77	NC_006663	GATAC	2	10	3089	3098	40 %	20 %	20 %	20 %	57854756
78	NC_006663	A	8	8	3116	3123	100 %	0 %	0 %	0 %	57854756
79	NC_006663	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
80	NC_006663	AT	3	6	3238	3243	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
81	NC_006663	TCT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854756
82	NC_006663	AAAG	2	8	3351	3358	75 %	0 %	25 %	0 %	57854756
83	NC_006663	TAA	2	6	3400	3405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
84	NC_006663	TAT	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
85	NC_006663	T	6	6	3470	3475	0 %	100 %	0 %	0 %	57854756
86	NC_006663	AT	3	6	3483	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
87	NC_006663	CATT	2	8	3494	3501	25 %	50 %	0 %	25 %	57854756
88	NC_006663	AGA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854756
89	NC_006663	TTAA	2	8	3533	3540	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
90	NC_006663	AAG	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854756
91	NC_006663	A	6	6	3560	3565	100 %	0 %	0 %	0 %	57854756
92	NC_006663	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
93	NC_006663	T	6	6	3604	3609	0 %	100 %	0 %	0 %	57854756
94	NC_006663	ATTATA	2	12	3657	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
95	NC_006663	GAA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854756
96	NC_006663	AAAG	2	8	3785	3792	75 %	0 %	25 %	0 %	57854756
97	NC_006663	ATTT	2	8	3827	3834	25 %	75 %	0 %	0 %	57854756
98	NC_006663	CAT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854756
99	NC_006663	CTCAA	2	10	4017	4026	40 %	20 %	0 %	40 %	57854756
100	NC_006663	AATTA	2	10	4029	4038	60 %	40 %	0 %	0 %	57854756
101	NC_006663	TGGA	2	8	4073	4080	25 %	25 %	50 %	0 %	57854756
102	NC_006663	ATG	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854756
103	NC_006663	A	6	6	4157	4162	100 %	0 %	0 %	0 %	57854756
104	NC_006663	TCT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854756
105	NC_006663	ATT	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
106	NC_006663	ACAGGT	2	12	4229	4240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57854756
107	NC_006663	TAA	2	6	4258	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
108	NC_006663	GGT	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57854756
109	NC_006663	TAT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
110	NC_006663	A	6	6	4368	4373	100 %	0 %	0 %	0 %	57854756
111	NC_006663	AATAT	2	10	4446	4455	60 %	40 %	0 %	0 %	57854757
112	NC_006663	A	6	6	4461	4466	100 %	0 %	0 %	0 %	57854757
113	NC_006663	AAG	2	6	4510	4515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
114	NC_006663	TA	3	6	4552	4557	50 %	50 %	0 %	0 %	57854757
115	NC_006663	A	6	6	4557	4562	100 %	0 %	0 %	0 %	57854757
116	NC_006663	ATTT	2	8	4593	4600	25 %	75 %	0 %	0 %	57854757
117	NC_006663	TCA	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854757
118	NC_006663	AGA	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
119	NC_006663	TAA	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854757
120	NC_006663	GAA	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
121	NC_006663	GAA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
122	NC_006663	AGG	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57854758
123	NC_006663	TTG	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57854758
124	NC_006663	TAGA	2	8	5229	5236	50 %	25 %	25 %	0 %	57854758
125	NC_006663	GGA	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57854758
126	NC_006663	GTTA	2	8	5266	5273	25 %	50 %	25 %	0 %	57854758
127	NC_006663	AACG	2	8	5282	5289	50 %	0 %	25 %	25 %	57854758
128	NC_006663	AGA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854758
129	NC_006663	ATT	3	9	5353	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854758
130	NC_006663	GCA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854758
131	NC_006663	TAATT	2	10	5395	5404	40 %	60 %	0 %	0 %	57854758
132	NC_006663	ATC	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854758
133	NC_006663	GCA	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854758
134	NC_006663	TAAA	2	8	5475	5482	75 %	25 %	0 %	0 %	57854758
135	NC_006663	ACTT	2	8	5493	5500	25 %	50 %	0 %	25 %	57854758
136	NC_006663	AG	3	6	5975	5980	50 %	0 %	50 %	0 %	57854759
137	NC_006663	ATA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854759
138	NC_006663	TA	3	6	6051	6056	50 %	50 %	0 %	0 %	57854759
139	NC_006663	TAC	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854759
140	NC_006663	A	6	6	6087	6092	100 %	0 %	0 %	0 %	57854759
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273	NC_006663	TAA	2	6	13185	13190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854769
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